8月1日下午，自治区防汛抗旱指挥部召开视频会商会，贯彻落实国务院和国家防总部署，全面部署第4号台风“妮妲”防御工作，并决定于18时起启动自治区防御台风Ⅲ级应急响应。
据气象预报，“妮妲”8月2日在广东沿海登陆后，下午到晚上以10级左右强度从玉林到贺州一带进入我区。其环流中心可能进入我区腹地，在我区停留时间长，风雨影响范围大。而且，“妮妲”的风和雨很可能都在夜间影响我区，加上7月31日，我区梧州市苍梧县发生5.4级地震，而“妮妲”又将从这一带进入我区，台风强降雨区与地震区重叠，这一区域也是地质灾害易发区，水库水电站数量多，我区防汛防台风安全形势极为严峻。
为此，会议要求，各地各部门充分认识台风可能带来的严重影响，全力做好各项防御减灾工作。重点开展水利工程震损情况检查，特别是全面检查水库（水电站）枢纽工程的主要建筑物、构筑物，防止地震对水利工程安全造成危害，并引发次生灾害。对检查发现的工程安全问题，要针对性地制定相应的应急处理措施，危及群众生命安全的，要及时转移受威胁群众，确保人民群众生命财产安全，确保最大限度地减少灾害造成的损失。
同时，切实做好防风工作，一方面要做好陆地防风工作，另外一方面按照“四个百分百”的要求，即海上作业船只100%进港、渔船渔排人员100%上岸、海上养殖人员100%撤离、危险区域人员100%转移，做好海上防风工作；全力做好强降雨及次生灾害防御工作，重点做好水库水电站安全度汛、山洪地质灾害防御、江河防洪和城市积涝处置以及旅游景区和旅客安全工作；做好抢险救灾各项准备工作；加强监测预警预报，加密会商，及时发布预报预警信息。
国家防总已派出工作组到我区检查指导“妮妲”防御，同时自治区水利厅将派出6个工作组赶赴受台风影响区域检查指导台风防御工作。7月31日，我区北海、钦州、防城港沿海三市就着手进行渔船回港及海上作业人员上岸转移工作，截至记者8月1日22时30分发稿时，三市已有1.2104万艘渔船回港，2.9466万名船上作业人员、6985名养殖人员上岸，其余未回港渔船及人员已就近找地方避风。